Цитохромный b6f комплекс, наряду с фотосистемами I и II (ФС I и ФС II), является одним из основных пигментбелковых комплексов, локализованных в тилакоидной мембране хлоропласта и вовлеченных в процесс фотосинтетической трансформации энергии. В электронтранспортной цепи фотосинтеза цитохромный комплекс занимает положение между ФС II и ФС I, контролируя общую скорость транспорта электронов от первичного донора к терминальному акцептору, и обеспечивая баланс между притоком электронов (от ФС II в случае нециклического и от ферредоксина в случае циклического транспорта) и оттоком электронов из ФС I. Важнейшей функцией цитохромного комплекса является сопряжение транспорта электронов по электронтранспортной цепи с формированием электрохимического потенциала протонов (ΔμH+) на мембране тилакоида, который используется для синтеза АТФ. С точки зрения энзимологии b6/f комплекс является пластохинол-пластоцианин оксидоредуктазой, т.е. катализирует окисление пластохинола и восстановление пластоцианина (Hope, Huilgol et al. 1992; Hope 1993).
Размеры стромальной части цитохромного b6/f комплекса в латеральной плоскости составляют 90 x 55Å, в люменальной части 120 x 75Å. В перпендикулярном мембране направлении размер цитохром b6/f комплекса составляет 100A (Kurisu, Zhang et al. 2003).
Согласно данным рентгеноструктурного анализа (Kurisu, Zhang et al. 2003) цитохромный b6/f комплекс содержит в себе четыре большие субъединицы с молекулярной массой от 17 до 34 кДа (цитохром f, цитохром b6, центр Риске и Qp-сайт). Также цитохромный b6/f комплекс содержит четыре малые гидрофобные субъединицы PetG, PetL, PetM, PetN, что приводит к димерному молекулярному весу 217 кДа (Whitelegge, Zhang et al. 2002).
Рисунок Восьмикомпонентный димерный цитохормный b6/f комплекс. Электронный и протонный транспортные пути внутри b6/f комплекса и расстояния между кофакторами в ангстромах(A, слева). Связанные кофакторы и белковые субъединицы (A, справа), где цветовая кодировка имеет следующее значение: цитохром b6 - голубой, субъединица IV - фиолетовая, цитохром f - красный, центр Риске - желтый, Pet G, Pet L, Pet M, Pet N - зелёные и мембрана - желтая зона. (В) Плотность электронных простетических групп: гема x, TDS, пластохинон, хлорофилл а, b-каротин и DOPC (Kurisu, Zhang et al. 2003).
Субъединицы: Цитохром f, Цитохром b6, Железо-серный центр Rieske (Fe-S), Qp сайт (субъединица IV), Pet G, Pet L, Pet M, Pet N.