Рисунок Расположение комплекса Рс и cyt f относительно мембраны тилакоида (картинка получена совмещением PDB структур комплекса Рс и cyt f – 2PCF и цитохромного b6f комплеса - 1Q90).
|
Рисунок Расположение комплекса Рс и cyt f относительно мембраны тилакоида (картинка получена совмещением PDB структур комплекса Рс и cyt f – 2PCF и цитохромного b6f комплеса - 1Q90). |
Модель (Kovalenko I.B. et al. 2006) учитывает сложную геометрию люминального пространства и достаточно подробно описывает электростатические взаимодействия белков пластоцианина и цитохрома f.
Взаимодействующие молекулы представляются как твердые тела с определенным распределением зарядов на них. Движение молекул осуществляется под действием стохастической броуновской силы и электростатических сил взаимодействия между молекулами.
Модель позволяет изучать влияние геометрических свойств системы (расстояния между мембранами и характера распределения комплексов на мембране), ионной силы и распределения зарядов на молекулах на кинетические характеристики взаимодействия белков.
Зеленым цветом обозначены восстановленные молекулы цитохрома, синим – окисленные молекулы пластоцианина. При окислении цитохрома его цвет меняется на темно-зеленый, при восстановлении пластоцианина его цвет меняется на красный.
Для просмотра необходим Cinepak.